Szkolenie pt.: „Overcoming brain organoid variability: choosing the right organoid protocol”

tłumaczenie poniżej

EN:

Multiple brain organoid and spheroid protocols have been described in the last 10 years. Although all retain the intrinsic properties of human brain development, differences rises in the recapitulation of multiple cell types and pace of whole organoid maturation. Often, organoids show regional heterochronicity needing to adapt or select the most suitable conditions for each experimental step. In this course we will revisit the multiple protocols highlighting the advantages and disadvantages in the context of human brain development in health and disease. We will highlight the multiple readouts and organoid based analysis and its pros- and cons-

The course will directed to experimental researchers with solid experience in neuroscience and iPSC/ESC derived models that want to incorporate brain organoid models in their research pipeline.

Main points of the training plan

1. Differentiation protocols available.
2. Maturation requirements: tips and tricks.
3. Microscopy analysis: histology and functional live microscopy.
4. Molecular analysis: RNAseq, scRNAseq, ATAC-seq.

Language of course: english

Sandra Acosta, PhD, Assistant Professor about herself:
As a scientist, I have a long trajectory in the fields of iPSC/ESC-derived brain organoids and genetic and neurodevelopmental disease modeling. I am Serra-Hunter Fellow and Assistant Professor at Department of Pathology and Experimental Therapeutics, University of Barcelona (April 2021). Throughout my career, I tackled questions related to the development of the central nervous system implementing in vitro and in vivo models of brain development in health and disease. Briefly, during my PhD, I got the chance to receive an early introduction and work with culture of 3D tumoroids (then called Neurospheres). Next, I expanded my international profile during two postdoctoral fellowships in the lab of Prof. Pierre Vanderhaeghen in Brussels (2009-2013) and Prof. Oliver at Northwestern University in Chicago (2014- 2018).
My lab is centered in understanding central questions of human brain development in health and disease. To this purpose, we tackle our questions from a multidisciplinary perspective. This approach lead us to developing several tools, from a genomics and technological AI perspective, and to contribute to the pathogenesis associated to developmental epilepsy, Alzheimer disease, as well as to understand how the human-most brain traits arise evolutionary.

PL:

Przez ostatnie 10 lat opisano wiele protokołów organoidów mózgowych i sferoidów. Chociaż wszystkie zachowują wewnętrzne właściwości rozwoju ludzkiego mózgu, pojawiają się różnice w odtwarzaniu wielu typów komórek i tempie dojrzewania całego organoidu. Często organizmy wykazują regionalną heterochroniczność, wymagającą dostosowania lub wyboru najbardziej odpowiednich warunków dla każdego etapu eksperymentu. W tym kursie omówimy protokoły, uwzględniając ich wady i zalety w kontekście rozwoju ludzkiego mózgu oraz odtwarzania stanów zdrowia i choroby. Będziemy bazować na licznych wynikach i analizach prac z wykorzystaniem organoidów, szczególnie zwracając uwagę na ich mocne i słabe strony.

Kurs będzie skierowany do badaczy z istotnym doświadczeniem w neuronaukach i modelach pochodnych iPSC/ESC, którzy chcą włączyć modele organoidów mózgowych do swojego programu badawczego.

Główne punkty merytoryczne szkolenia:

1. protokoły różnicowania;
2. dojrzewanie: wymagania, wskazówki, dobre praktyki i rady;
3. analiza mikroskopowa: histologia oraz czynnościowa mikroskopia na żywo;
4. analiza molekularna: RNAseq, scRNAseq, ATAC-seq.

Język szkolenia: angielski

Sandra Acosta, PhD, Assistant Professor o sobie:
Jako naukowiec mam długą historię w dziedzinie organoidów mózgowych pochodnych iPSC/ESC oraz modelowaniu chorób genetycznych i neurorozwojowych. Jestem Serra-Hunter Fellow oraz Assistant Professor w Department of Pathology and Experimental Therapeutics, University of Barcelona (od kwietnia 2021 r.). Przez całą moją karierę zajmowałam się kwestiami związanymi z rozwojem centralnego układu nerwowego, wdrażając modele in vitro i in vivo rozwoju mózgu w stanie zdrowia i choroby. Podczas doktoratu miałam okazję otrzymać wczesne wprowadzenie i pracować nad hodowlą 3D tumoroidów (wtedy nazywanych neurosfery). Następnie rozszerzyłam swoje międzynarodowe doświadczenie podczas dwóch staży podoktorskich w laboratorium prof. Pierre’a Vanderhaeghena w Brukseli (2009-2013) i prof. Olivera na Northwestern University w Chicago (2014-2018).

Moje laboratorium skupia się na rozwiązywaniu kluczowych kwestii związanych z rozwojem ludzkiego mózgu w stanie zdrowia i choroby. W tym celu podchodzimy do naszych badań z interdyscyplinarnej perspektywy. To podejście doprowadziło nas do opracowania kilku narzędzi, od genomiki po technologicznie zaawansowane sztuczne inteligencje, i do wniesienia wkładu w patomechanizmy związane z padaczką rozwojową, chorobą Alzheimera, a także w zrozumienie, w jaki sposób powstają najbardziej ludzkie cechy mózgu w ewolucji.

Szkolenie odbędzie się 25 lutego 2025 roku w godzinach 9:00-16:00.

Forma szkolenia: on-line.