Szkolenie pt.: „Metodyka pracy z systemami CRISPR/Cas u roślin: warsztaty projektowania kaset ekspresyjnych i analizy efektów edycji”

System CRISPR/Cas to obecnie jedno z najczęściej wykorzystywanych narzędzi w precyzyjnej inżynierii genomu roślin, pozwalające na sprawne generowanie zmian typu knockout oraz celowaną edycję sekwencji w gatunkach modelowych i użytkowych. Technologia ta umożliwia badaczom modyfikację szlaków metabolicznych oraz wprowadzanie pożądanych cech bezpośrednio w specyficznych miejscach genomu, co znacząco przyspiesza procesy badawcze i hodowlane. 

Warsztaty obejmują kompleksowe wprowadzenie do technologii CRISPR/Cas w układach roślinnych – od gatunków diploidalnych po wyzwania związane z roślinami poliploidalnymi o wysokim stopniu złożoności genomu (np. pszenica, rzepak). 

Kurs łączy solidne podstawy teoretyczne z intensywną częścią praktyczną, przygotowując uczestnika do samodzielnego przejścia przez pełny cykl badawczy: od doboru strategii edycji, poprzez projektowanie molekularne, aż po zaawansowaną weryfikację uzyskanych zmian.

Szkolenie skierowane jest do pracowników naukowych i doktorantów nauk biologicznych, rolniczych i pokrewnych, którzy posiadają podstawową wiedzę z zakresu biologii molekularnej i chcą opanować umiejętność precyzyjnego kształtowania genomu roślin w swojej pracy badawczej.

Program szkolenia

• Strategie edycji genomu roślinnego – zasady projektowania, dobór celów i wariantów narzędzi molekularnych.
• Projektowanie narzędzi do precyzyjnej edycji – zadania praktyczne z wykorzystaniem systemów bioinformatycznych.
• Inżynieria molekularna i architektura wektorów ekspresyjnych – budowa kaset i dobór komponentów systemu.
• Metody wdrażania i walidacji systemów edycji w komórkach roślinnych – przegląd ścieżek dostarczania i testów aktywności.
• Analiza i interpretacja wyników edycji genomu – zadania praktyczne oraz weryfikacja uzyskanych zmian.

dr inż. Magdalena Klimek-Chodacka, prof. URK – profesor Uczelni na Wydziale Biotechnologii i Ogrodnictwa Uniwersytetu Rolniczego w Krakowie specjalizująca się w nowoczesnych metodach inżynierii genetycznej roślin. W swojej pracy badawczej opracowała skuteczne procedury edycji genomu marchwi, co przyczyniło się do rozwoju nowych kierunków w biotechnologii gatunków warzywnych. Skupia się na doskonaleniu technologii CRISPR/Cas, rozwijając zarówno wektorowe, jak i bezwektorowe (DNA-free) metody modyfikacji genomów roślin użytkowych.

Swoje doświadczenie naukowe budowała w czołowych światowych ośrodkach, m.in. na East Carolina University w USA (w zespole prof. Yipinga Qi) oraz w Maladze (2025, w grupie Pablo Manavela). Jest laureatką grantów Narodowego Centrum Nauki, w tym projektu OPUS, oraz programu NAWA. Aktywnie kształtuje debatę naukową jako członkini zespołu edytorskiego czasopisma Scientific Reports oraz recenzentka licznych renomowanych czasopism międzynarodowych. Jej dorobek był nagradzany Nagrodami Rektora UR, a jej prace publikowane są w wiodących czasopismach z listy JCR.

Szkolenie odbędzie się w dniach 2 i 3 lipca 2026 roku w godzinach 9:00-12:00