Warsztat pt.: „Bioinformatyka dla biologów: Podstawy Linux’a”

21 września 2024 roku

09:00-17:00

Warsztat ma na celu wprowadzenie uczestnika w środowisko systemu Linux. Do tego celu wykorzystamy dystrybucję Linux Debian (lub Ubuntu). Wymagana jest znajomość obsługi komputera w stopniu średniozaawansowanym (poruszanie się po katalogach, podstawy programowania w dowolnym języku). Podczas kursu uczestnicy zapoznają się z filozofią systemów opartych na jądrze Linux’a. W dalszej części teoretycznej kursu zostanie pokazane wykorzystanie tej architektury do prowadzenia analiz bioinformatycznych.

Część praktyczna będzie obejmować następujące zagadnienia:

  1. Uruchomienie i obsługa terminala.
  2. Co to jest bash i jakie są podstawowe komendy.
  3. Instalacja i tworzenie środowiska wirtualnego typu conda.
  4. Instalacja podstawowych narzędzi bioinformatycznych.

Wymagania sprzętowe:

  • Minimum 4 wątkowy procesor.
  • Pamięć RAM minimum 16 GB
  • HDD minimum 1 TB.
  • Zainstalowany Linux Debian, Ubuntu.

Warsztat odbędzie się 21 września 2024 roku w godzinach 9:00-17:00 (w trakcie zaplanowane jest 4 godziny kursu teoretycznego oraz 4 godziny praktyki).  

Forma szkolenia: on-line.

Prowadzący:

Dr hab. Łukasz Łaczmański, prof. IITD PAN jest absolwentem biotechnologii na Uniwersytecie Wrocławskim. W 2003 roku obronił doktorat w Zakładzie Biofizyki Instytutu Biochemii i Biologii Molekularnej Uniwersytetu Wrocławskiego. Następnie pracował jako diagnosta laboratoryjny. W latach 2006-2016 zorganizował i prowadził Laboratorium Endokrynologii Molekularnej na Uniwersytecie Medycznym we Wrocławiu. Od 2016 roku jest samodzielnym pracownikiem Instytutu Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN we Wrocławiu, a od 2019 roku kieruje nowo utworzonym Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki.

Zajmuje się propagowaniem nowoczesnych metod molekularnych, takich jak wysokoprzepustowe sekwencjonowanie materiału genetycznego (NGS) w diagnostyce medycznej.

Rejestracja

I tura rejestracji uczestnictwa trwa do 8 sierpnia 2024 roku. Zgłoszenia udziału należy kierować poprzez formularz -> LINK

Platforma

Aby bez przeszkód móc uczestniczyć w wydarzeniu użytkując platformę ClickMeeting wystarczy dostęp do Internetu i aktualna przeglądarka internetowa (Chrome, Opera, Firefox, Edge). Zaleca się używać komputer z 4-wątkowym procesorem, min. 8 GB pamięci RAM i aktualnym systemem operacyjnym Windows 8.1, Windows 10 lub Windows 11. W praktyce jednak wystarczy dowolny sprzęt, który płynnie wykonuje zadania biurowe. Platforma streamingowa działa także na systemach operacyjnych Apple oraz dystrybucjach Linux, w tym – systemie Android i ChromeOS.

Ze swojej strony zapewniamy pomoc techniczną w konfiguracji, jak również wsparcie ze strony przedstawicieli platformy.

Terminy

• do 12 września 2024 roku – zgłoszenia uczestnictwa, poprzez wypełnienie formularza internetowego,
• 21 września 2024 roku – termin wydarzenia,
• od 23 września 2024 roku – wysyłka papierowych materiałów – certyfikatów uczestnictwa.

Opłaty

Opłata dla wszystkich uczestników warsztatu wynosi 1000 zł brutto (w tym 23% VAT) w I turze rejestracji, 1100 zł brutto (w tym 23% VAT) w II turze rejestracji lub 1200 zł brutto (w tym 23% VAT) w III turze rejestracji* – osoby planujące skorzystać ze zwolnienia z podatku VAT w sytuacji finansowania uczestnictwa ze środków publicznych proszone są przesłanie informacji przed uiszczeniem opłaty.

Termin rejestracji
Opłata za udział
do 08.08.2024 r.
1000 zł brutto
od 09.08.2024 r. do 29.08.2024 r.
1100 zł brutto
od 30.08.2024 r. do 12.09.2024 r.
1200 zł brutto

DANE DO WPŁAT

Fundacja na rzecz promocji nauki i rozwoju TYGIEL
ul. Głowackiego 35/348, 20-060 Lublin
NIP 946-26-49-975
Numer rachunku: 70 1140 2004 0000 3102 7533 8307
Nazwa Banku: mBank (BRE Wydz. Bankowości Elektronicznej)

Tytuły przelewów: BDB linux + imię i nazwisko Uczestnika

Opłata warsztatowa zawiera podatek VAT (23%) – osoby planujące skorzystać ze zwolnienia z podatku VAT w sytuacji finansowania uczestnictwa ze środków publicznych proszone są przed uiszczeniem opłaty o poinformowanie nas o tym mailowo oraz o dostarczenie oświadczenia o zwolnieniu z VAT zawierającego następujące informacje:

  • podstawę prawną,
  • imię i nazwisko uczestnika,
  • datę i nazwę warsztatu,
  • nazwę organizatora – Fundacji na rzecz promocji nauki i rozwoju TYGIEL,
  • podpis osoby upoważnionej ze strony instytucji ubiegającej się o skorzystanie ze zwolnienia z VAT w kwestiach finansowych.

W odpowiedzi potwierdzimy otrzymanie oświadczenia oraz udzielimy informacji na temat wysokości opłaty warsztatowej w wartości netto.

Regulamin

Regulamin Warsztatu dostępny jest tutaj -> LINK

Kontakt

szkolenia@fundacja-tygiel.pl

Partnerzy Fundacji TYGIEL

Wspierają nas