Warsztat pt.:”Podstawy techniki PCR, optymalizacja reakcji, rozwiązywanie problemów”

21 kwietnia 2023 roku
09:00-14:00

Do kogo jest skierowany warsztat?

Warsztat skierowany jest do osób, które prowadzą lub planują prowadzić badania naukowe z wykorzystaniem technik PCR, a także chcą poszerzyć lub usystematyzować wiedzę z tego zakresu na poziomie akademickim. Program został przygotowany na podstawie wiedzy teoretycznej i bogatego doświadczenia praktycznego Prowadzącej. Spotkanie zostanie przeprowadzone w formule online. Uczestnicy podczas rejestracji mają możliwość wskazania, jakie zagadnienia merytoryczne są dla nich najbardziej istotne. Formuła warsztatu umożliwi także interakcję pomiędzy Uczestnikami i Prowadzącą.

 Zagadnienia realizowane w ramach warsztatu:

1. Wymagania dla laboratorium diagnostycznego opartego o techniki amplifikacji kwasów nukleinowych
2. Jak przygotować się do nastawiania reakcji PCR
3. Strategia nastawiania reakcji PCR – ogólne zasady
4. Czynniki wpływające na efektywność PCR (na co zwrócić uwagę, praktyczny przewodnik)
– jakość i ilość matrycy DNA
– wybór buforu do PCR
– optymalizacja jonów Mg2+
– optymalizacja  dNTP
– wybór odpowiedniej polimerazy (cechy polimeraz DNA)
– zasady doboru starterów
– profil temperaturowo-czasowy
5. Zagrożenia w metodach amplifikacji kwasów nukleinowych – jak zapobiegać kontaminacji
6. Jakie stosować kontrole w PCR i po co?
7. Jak rozwiązać problemy (produkty niespecyficzne, inhibitory) związane z  amplifikacją matrycy
8. Złożona reakcja PCR (ang. multiplex PCR) – optymalizacja
9. Pytania/dyskusja

Warsztat odbędzie się 21 kwietnia 2023 r. w godzinach 09:00-14:00.

Dodatkowe informacje:

Po zakończonym warsztacie Uczestnikom zostanie udostępniona prezentacja w formacie .pdf. Ponadto, każdy uczestnik otrzyma certyfikat potwierdzający uczestnictwo wraz z opisem zakresu merytorycznego przedstawionego w trakcie spotkania.

Prowadząca:

Dr hab. Beata Krawczyk, profesor uczelni, Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny, Katedra Biotechnologii Molekularnej i Mikrobiologii.

Biogram naukowy:

Pracownik Katedry Biotechnologii Molekularnej i Mikrobiologii na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej od roku 1991. Stopień naukowy doktora nauk przyrodniczych w dyscyplinie biologia (1997). Stopień naukowy doktora habilitowanego nauk biologicznych w dyscyplinie biologia – 2009 r. W 2012 r – staż naukowy w University of the Mediterranean, Faculty of Medicine of Marseilles, Francja, jako profesor wizytujący. Od 2016 roku zajmuje stanowisko profesora uczelni.

2009-2019 – członek Rady Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej; 2011- medal Komisji Edukacji Narodowej; 2021 – członek Rady Naukowej PG w dyscyplinie Inżynieria Biomedyczna. Działalność w Polskim Towarzystwie Mikrobiologów od 2001 roku. 2008 -2012 sekretarz Oddziału Gdańsk PTM, od 2012 – 2022 przewodnicząca Oddziału Gdańsk PTM. Członek Komitetu Mikrobiologii Polskiej Akademii Nauk w latach 2012-2015. Od 2020 Członek Rady Towarzystw Naukowych przy Prezydium Polskiej Akademii Nauk jako reprezentant Federacji Polskich Towarzystw Medycznych.

Reprezentowanie dyscyplin naukowych: Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych/Nauki biologiczne; Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych/Nauki chemiczne; Dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych/Inżynieria biomedyczna.

Zainteresowania zawodowe:

• diagnostyka molekularna w mikrobiologii, epidemiologia molekularna,
• biotechnologia – konstrukcja nowych molekularnych testów diagnostycznych do wykrywania, identyfikacji oraz typowania genetycznego drobnoustrojów,
• nowe natywne i modyfikowane polimerazy DNA jako narzędzia w reakcji PCR,
• mikrobiologia kliniczna: sepsa/urosepsa o etiologii coli, zakażenia układu moczowego (ZUM); patogeneza, wirulencja, antybiotykooporność E. coli/Klebsiella sp./Enterococcus sp.

Szerokie doświadczenie w technikach amplifikacji kwasów nukleinowych i metodach typowania genetycznego drobnoustrojów.

Polecane prace przeglądowe/książki akademickie/skrypty:

1. Śpibida, M., Krawczyk, B., Olszewski, M., & Kur, J. (2017). Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, 58(1), 133-142. https://doi.org/10.1007/s13353-016-0371-4
2. Krawczyk B., Kur J. Diagnostyka molekularna w mikrobiologii. Wydawnictwo PG. 2008.

Rejestracja

Przedłużona tura rejestracji uczestnictwa trwa do 13 kwietnia 2023 roku. Zgłoszenia udziału należy kierować poprzez formularz -> LINK

Platforma

• Platforma ClickMeeting pozwoli na:
  • uczestnictwo w warsztacie poprzez urządzenia mobilne takie jak: laptop, smartfon, tablet (uczestnikom rekomendujemy aby podczas warsztatu korzystali z komputera stacjonarnego, laptopa lub aplikacji mobilnej ClickMeeting),
  • uczestnictwo w warsztacie bez posiadania kamery internetowej, zalecany jest sprawny mikrofon,
  • obecność i ciągłe wsparcie Organizatorów.

Wymagania techniczne:

• posiadanie komputera, smartfonu lub tabletu z połączonym Internetem,

• Procesor dwurdzeniowy 2GHz lub lepszy (zalecany czterordzeniowy);

• 2GB pamięci RAM (zalecane 4GB lub więcej);

• System operacyjny taki jak Windows 8 (zalecany Windows 10), Mac OS wersja 10.13 (zalecana najnowsza wersja), Linux, Chrome OS.

• wbudowany lub zewnętrzny mikrofon, opcjonalnie kamera internetowa.

Wymagane jest korzystanie z najaktualniejszych oficjalnych wersji Google Chrome, Mozilla Firefox, Safari, Edge (Chromium), Yandex lub Opera.

Ze swojej strony zapewniamy pomoc techniczną w konfiguracji, jak również wsparcie ze strony przedstawicieli platformy.

Terminy

• do 13 kwietnia 2023 roku – zgłoszenia uczestnictwa, poprzez wypełnienie formularza internetowego,
• 21 kwietnia 2023 roku – termin wydarzenia,
• od 25 kwietnia 2023 roku – wysyłka papierowych materiałów – certyfikatów uczestnictwa.

Opłaty

Opłata dla wszystkich uczestników warsztatu wynosi 600 zł brutto (w tym 23% VAT) w I turze rejestracji, 675 zł brutto (w tym 23% VAT) w II turze rejestracji lub 750 zł brutto (w tym 23% VAT) w III turze rejestracji* – osoby planujące skorzystać ze zwolnienia z podatku VAT w sytuacji finansowania uczestnictwa ze środków publicznych proszone są przesłanie informacji przed uiszczeniem opłaty.

DANE DO WPŁAT

Fundacja na rzecz promocji nauki i rozwoju TYGIEL
ul. Głowackiego 35/348, 20-060 Lublin
NIP 946-26-49-975
Numer rachunku: 70 1140 2004 0000 3102 7533 8307
Nazwa Banku: mBank (BRE Wydz. Bankowości Elektronicznej)

Tytuły przelewów: PCR 1 + imię i nazwisko Uczestnika

Opłata warsztatowa zawiera podatek VAT (23%) – osoby planujące skorzystać ze zwolnienia z podatku VAT w sytuacji finansowania uczestnictwa ze środków publicznych proszone są przed uiszczeniem opłaty o poinformowanie nas o tym mailowo oraz o dostarczenie oświadczenia o zwolnieniu z VAT zawierającego następujące informacje:

• podstawę prawną,
• imię i nazwisko uczestnika,
• datę i nazwę warsztatu,
• nazwę organizatora – Fundacji na rzecz promocji nauki i rozwoju TYGIEL,
• podpis osoby upoważnionej ze strony instytucji ubiegającej się o skorzystanie ze zwolnienia z VAT w kwestiach finansowych.

W odpowiedzi potwierdzimy otrzymanie oświadczenia oraz udzielimy informacji na temat wysokości opłaty warsztatowej w wartości netto.

Regulamin

Regulamin Warsztatu dostępny jest tutaj -> LINK

Kontakt

szkolenia@fundacja-tygiel.pl